L’objectif de cette unité d’enseignement est d’introduire de manière appliquée les notions de génétique quantitative. La génération et l’analyse de données à haut-débit sera abordées dans le cadre de deux séries complémentaires de travaux pratiques.

Travaux pratiques expérimentaux :
- Analyse de liaison classique (croisement, génération de la descendance, phénotypage)
- Analyse de liaison par pool de descendants
- Edition via CRISPR-Cas9
- Séquençage d’un génome complet via la stratégie Oxford Nanopore MinION

Travaux pratiques bioinformatiques :
- Analyse des données de séquençage : Illumina et MinION
- Établissement des cartes génomiques et analyses de pools de descendants
- Séquençage de type MinION et détection des variants structuraux
- Analyses QTL et aussi pool de descendants
- Recherche et analyse des régions
- Comparaison des séquences des parents

- Disséquer l’origine génétique de caractères complexes
- Acquérir des techniques pour des analyses de liaison génotype-phénotype
- Séquencer une population de cartographie et des génomes complets
- Analyser des données de séquençage à haut-débit